科学家使用新型计算机工具发现了超过100,000种未知病毒
对病毒多样性的了解将揭示新出现的病原体的起源,并改善对新流行病的监测。由瓦伦西亚理工大学(UPV)和西班牙国家研究委员会(CSIC)的联合中心植物分子和细胞生物学研究所(IBMCP)参与的国际科学家团队迈出了重要的一步了解病毒的多样性。该团队使用一种新的计算机工具分析了过去 15 年间在全球收集的 570 万份生物样本,发现了超过 130,000 种新的 RNA 病毒(例如目前导致 COVID-19 大流行的 SARS-CoV-2 冠状病毒)年。这一发现发表在《自然》杂志上,代表迄今为止描述的病毒 RNA 种类数量增加了十倍。

为了进行这项分析,多学科团队开发了 Serratus,这是一种云计算(亚马逊网络服务,AWS)基础设施,它使用由 22,500 个计算机处理器 (CPU) 组成的集群,可以大规模搜索数百万千兆字节 (PB) 的病毒序列公共数据库中可用的测序数据。
对某些病毒科的详细分析导致发现了 30 多种新的冠状病毒物种,其中包括鱼类和两栖动物等水生脊椎动物的有趣例子,其冠状病毒的基因组被分割成两个片段,这一特征已在其他病毒科中有所描述,但以前没有在任何冠状病毒中检测到。
UPV 科学家使用 Serratus 分析导致人类丁型肝炎的病毒,一种称为 Delta 的病毒剂,其基因组大小最小且来源未知。此外,具有丁型肝炎样病毒的环境样本显示存在具有超紧凑基因组的新型病毒形式(只有 300 个碱基,构成遗传物质的化学单位)。获取更多前沿科技 研究进展 访问:https://byteclicks.com
在本研究过程中获得的所有病毒的数据库和开发的工具集都是免费和公开的(http://www.serratus.io)。这些工具可用于表征地球存在的所有病毒的多样性,并帮助世界为可能的新流行病做好准备。