蛋白质功能

研究人员开发了迄今为止最全面的数据库，以帮助了解蛋白质聚集的基础，这是一种与衰老和多种病理相关的现象。新资源汇集了 12 种研究最多的模式生物蛋白质组，这些生物覆盖了遥远的生物进化枝，并包含超过 50 万个具有形成聚集体倾向的蛋白质区域的预测。

蛋白质结构和功能的形成，很大程度上取决于侧链原子间的相互作用，因此，精准的蛋白质侧链预测（PSCP）是解决蛋白质结构预测和蛋白质设计难题的关键一环。但此前蛋白质结构预测大多聚焦于主链结构，侧链结构预测始终是一个未被完全解决的难题。

根据蛋白质结构预测配体结合位点在阐明蛋白质功能和药物设计方面有许多应用，具体包括药物副作用预测、基于片段的药物发现、对接优先级排序、基于结构的虚拟筛选和基于结构的靶标预测（或称为反向虚拟筛选）等方面。它通常是复杂的计算药物设计工程中的关键步骤。鉴定可与蛋白质结合的配体或小分子也是预测蛋白质功能的重要线索。可以直接在蛋白质的3D结构内确定配体和其他小分子，或者可以使用蛋白质的3D结构预测配体结合位点，从而帮助注释蛋白质。