新乳腺癌数据库可以帮助乳腺癌患者进行个性化治疗

新乳腺癌数据库可以帮助乳腺癌患者进行个性化治疗
一个新乳腺癌数据库有助于根据每个患者癌症中独特的基因变化为个性化治疗奠定基础

目前所有的乳腺癌药物都首先在细胞系中进行了测试。每个细胞系开始都是针对患者的癌症。这样,每个细胞系都是该患者疾病的替代物。南卡罗来纳州医科大学的研究人员开发了一个包含40个乳腺癌细胞系新数据库,该数据库将帮助研究人员加深对这些细胞系的了解,并加快新的基因靶向疗法的开发。

Stephen P. Ethier博士说:“细胞系是乳腺癌研究的第一线,因为它们来自真实的患者,并表现出该患者所经历的疾病特征。” ,博士是MUSC病理学和检验医学系的教授,也是MUSC Hollings癌症中心的研究员。

Ethier说,细胞系代表了癌症的本质,这是基因组的多方面疾病。然而,在研究中经常绕开癌症这一复杂疾病的广阔前景,而只关注一两个基因变化。埃希尔(Ethier)认为,这(目前的研究方式)过于狭窄,开发更好的疗法将需要评估整个基因组特征。

最近发表在《npj Breast Cancer》上的一篇文章中,Ethier和他的团队描述了癌症研究人员新数据资源实施情况。SUM乳腺癌细胞系知识库,或SLKBase,将通过在总共40个SUM和其它患者来源细胞系的易于导航的基因组,蛋白质组和其他“组学”信息推动该领域的发展。该数据库最终可以为乳腺癌患者识别,开发和实施真正个性化基因靶向疗法做出贡献。

Stephen Ethier博士和他的团队希望他们的数据库最终能扩展到包括所有类型癌症的癌细胞系。

基于每个癌症患者中独特基因变化的个性化或靶向治疗一直是肿瘤学研究和医学领域的长期目标,并且已经取得了重大进展。但是,实施真正个性化的治疗策略进展缓慢。

其中一个障碍是难以识别和锁定具有致病功能的基因变化。

Ethier认为,数百个基因可能在癌细胞中产生了错误。他解释说:“然而,大多数被改变的基因在疾病的生物学中都没有发挥任何作用。”

研究人员如何确定哪些基因突变很重要并且值得针对性治疗?

在南卡罗来纳州临床与转化研究所的试点拨款资助下,Ethier及其团队为SLKBase构建了专用工具,以帮助回答这一问题。

针对这些驱动癌症生长的功能基因的疗法可能是最有效的。从超过800种针对性实验药物库中,“ Druggable Signature Tool”可识别出可能针对癌细胞的有效药物,因为它们靶向的是基本基因。

SLKBase网站向希望了解更多有关乳腺癌细胞系或访问庞大的基因组和蛋白质组学知识库的人开放。

但是,乳腺癌仅仅是开始。几乎每种癌症类型的患者都有500多种癌细胞系,Ethier希望最终将它们全部纳入SLKBase。

根据Ethier所言,驱动癌症的基因变化比它们发生的组织更重要。癌症是基因组疾病,无论它们发生在身体的哪个部位。因此,任何癌症都有望对针对其基因组特征的疗法产生反应。

Ethier说:“在某个时候,我们必须停止担心是乳腺癌,肺癌还是结肠癌。” “我们应该更加强调该癌症的基因组特征,因为癌症是基因组疾病。”

Ethier最近与MUSC研究开发基金会签署了一项选择协议,这将使他的创业公司Sextant Oncology LLC能够继续推广使用癌细胞系及其功能衍生物。Sextant Oncology的任务是开发单个细胞系的逆向工程策略,这些策略最终可用于对患者进行靶向药物治疗预测。

访问数据库:https://sumlineknowledgebase.com

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