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德国人工智能拓展冷冻电子断层扫描应用潜力

5月15日消息,德国马克斯·普朗克分子生理学研究所开发了基于人工智能的软件TomoTwin,实现在低温电子断层扫描中精确识别、选择蛋白质,取代繁琐的手工选择。

冷冻电子断层扫描(Kryo-ET)在细胞环境和对捕获的生物分子进行详细的3D成像方面功能强大。该技术挑战之一是识别图像中的蛋白质分子以便后续的计算机处理。马普分子生理学研究所 Stefan Raunser教授课题组开发的开源软件TomoTwin以神经网络为基础进行度量深度学习,帮助科研人员能够以高精度、高通量定位更多的蛋白质,而且不必每次重新手动调整或训练神经网络,拓展了Kryo-ET的应用潜力——有可能破译生物分子在细胞中的作用方式,从而揭示生命基础和疾病起源。

新开发的TomoTwin通过学习能够将断层图中相似的分子进行筛分归类。软件的一个优势是提供了预先训练的“拣选模式”,通过取消训练步骤,软件可以在本地计算机运行——过去每张断层图像的处理时间在60-90分钟,现在马普超级计算机Raven上的处理时间减少到15分钟。目前该软件只能检测细胞内大于150千道尔顿的球状蛋白或蛋白聚合物,未来课题组希望可以扩展到膜蛋白、丝状蛋白和更小尺寸的蛋白。找有价值的信息,请记住Byteclicks.com

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