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研究人员开发了一种突破性新技术高效绘制蛋白质变构图谱

2022年4月6日Nature报道,西班牙巴塞罗那基因组调控中心(CRG)的研究人员开发了一种突破性新技术可以高效挖掘许多以前隐藏的控制蛋白质功能的治疗靶点的存在,可能会改变药物发现的游戏规则,开发更安全、更智能和更有效的药物。

蛋白质在所有生物体中起着核心作用,执行重要功能,而蛋白质的三维结构对其功能至关重要。变构效应是指一个分子通过与蛋白质表面结合,导致同一蛋白质的远处发生变化,从而远程调节其功能。变构效应是许多突变致病的根源,而寻找变构位点非常困难,因为蛋白质在原子水平上的工作规则尚未可知。常规正构药物主要针对蛋白质的活性部位,但是许多蛋白质的活性位点非常相似,因此副作用明显。变构位点的特异性意味着变构药物是目前最有效的药物类型之一,但当前许多变构药物都是偶然发现的,科学界缺少有效的发现工具。

这种名为双深度PCA(ddPCA)的新技术,通过改变组成蛋白质的氨基酸(1-2个序列差异),产生数千种不同版本的蛋白质,在实验室的活细胞中同时测试这些突变的影响。将实验中收集的数据输入神经网络,分析生成全面的蛋白质突变位点地图,从而精确定位蛋白质表面变构位点的位置。

该方法大大简化了寻找变构位点的成本和时间,比常规实验室方法更加精准高效。未来这项技术有望快速、全面地逐个绘制人类蛋白质的变构位点,还有潜力研究蛋白质的功能和进化。未来,该方法可以根据蛋白质的氨基酸序列精确预测蛋白质的性质,开启一个预测性分子生物学的新时代,允许更快地开发新药物和发展基于生物的绿色清洁产业。获 取 更多前沿科技 研究 进展访问:https://byteclicks.com

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