研究人员建立新片段库加速药物发现
药物要想发挥作用,通常必须与机体内蛋白质结合。就像锁和钥匙,药物分子部分片段必须适合目标蛋白质的凹处或空腔。多年来,由Manfred Weiss博士领导的HZB大分子晶体学系(MX)团队与Gerhard Klebe教授(马尔堡大学)领导的药物设计小组一直致力于建立片段库。有助于加速药物发现。
这些片段库由小的有机分子(片段)组成,通过这些片段可以探测和绘制蛋白质表面重要功能空腔。蛋白质晶体中充满了片段,然后使用强大的X射线分析。这样就可以在原子分辨率的水平上获得三维结构信息。除此之外,还可以发现特定分子片段与目标蛋白的对接情况。这些物质库的开发是作为Frag4Lead联合研究项目的一部分进行的,并得到了德国联邦教育和研究部(BMBF)的资助。
MX团队(MX代表大分子晶体学)目前已经公布了一个名为 “F2X-Universal “库的化学多样性片段库的设计,该库由1103个化合物组成。从该库中提取了具有代表性的96个化合物,这被称为F2X Entry Screen。在公布该库的过程中,HZB的MX团队现已在瑞典隆德的MAX IV X射线源和BESSY II上成功测试和验证了此选择。
在这项研究中,HZB和MAX IV团队通过筛选内皮抑素和Aar2 / RnaseH蛋白复合物作为目标酶,验证了F2X Entry库的效率。下一步,MX团队将使用整个通用库。