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COVIDome在线门户可以快速加速全球冠状病毒研究

为了在全球范围内进一步加速 COVID-19 研究,科罗拉多大学安舒茨医学院的研究人员创建了一个多维数据集,称为 COVIDome 数据集,来自住院的 COVID-19 患者与阴性对照。该团队现在已经启动了一个名为COVIDome Explorer的公共在线门户,以实时共享该数据

近日发表在Cell Reports杂志上的一篇新论文详细说明了数据集是如何生成的。

尽管在所有这些领域都取得了很大进展,但由于缺乏可供任何人实时分析和重新分析的可广泛访问的公共数据集,COVID-19 的研究速度受到了阻碍。COVIDome Explorer 的使命是为 COVID-19 的临床管理开发更好的预防、诊断和治疗工具。

研究人员希望这个在线门户网站将在全球范围内迅速加速 COVID-19 数据共享、假设检验和发现。

为了创建 COVIDome Explorer,CU Anschutz Medical Campus 不同生物医学研究领域的专家在他们的实验室中创建了多维数据集。这些被收集和组合起来,通过在线门户共享。数据集包括人口统计学和临床​​数据,以及全血转录组的匹配分析、血浆和红细胞代谢组的分析、通过质谱流式细胞术和血清转化分析进行的深度免疫表型分析。

COVIDome 数据集和相应的 Explorer 是在 Linda Crnic 唐氏综合症研究所进行类似的持续努力之后建模的,其中 COVIDome 团队的成员之前开发了人类三体项目及其TrisomExplorer数据门户。利用 TrisomExplorer 的前沿工具和技术,该团队能够在几周内创建 COVIDome Explorer 并将其提供给公众,以帮助推进 COVID-19 研究。

COVID-19 大流行造成的全球健康危机进一步强调了快速合作、开放获取审查中的手稿和数据共享的必要性。现在比以往任何时候都更重要的是,随着 COVID-19 Delta 变体的兴起和突破性感染率的上升,能够轻松及时地访问 COVID 数据以对抗大流行并推进可用的最佳科学数据至关重要。获取更多前沿科技 研究进展 访问:https://byteclicks.com

COVIDome 项目是 CU 医学院和研究副校长办公室之间的合作伙伴关系,由 Joaquin Espinosa 博士和 Thomas Flaig 医学博士共同领导。要了解更多信息,请访问www.covidome.org

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