蛋白质结构预测配体结合位点

美国华盛顿大学医学院的研究人员开发出一款便捷免费的蛋白质结构预测新工具“RoseTTAFold”。在这项新研究中，由 Baker 领导的一组计算生物学家开发了 RoseTTAFold 软件工具。它使用深度学习根据有限的信息快速准确地预测蛋白质结构。如果没有此类软件的帮助，可能需要数年的实验室工作才能确定一种蛋白质的结构。

根据蛋白质结构预测配体结合位点在阐明蛋白质功能和药物设计方面有许多应用，具体包括药物副作用预测、基于片段的药物发现、对接优先级排序、基于结构的虚拟筛选和基于结构的靶标预测（或称为反向虚拟筛选）等方面。它通常是复杂的计算药物设计工程中的关键步骤。鉴定可与蛋白质结合的配体或小分子也是预测蛋白质功能的重要线索。可以直接在蛋白质的3D结构内确定配体和其他小分子，或者可以使用蛋白质的3D结构预测配体结合位点，从而帮助注释蛋白质。