科学家开发出拥有超高准确度的蛋白质结构预测新工具免费下载
美国华盛顿大学医学院的研究人员开发出一款便捷免费的蛋白质结构预测新工具“RoseTTAFold”。在这项新研究中,由 Baker 领导的一组计算生物学家开发了 RoseTTAFold 软件工具。它使用深度学习根据有限的信息快速准确地预测蛋白质结构。如果没有此类软件的帮助,可能需要数年的实验室工作才能确定一种蛋白质的结构。
与 DeepMind 不同,UW Medicine 团队的方法,他们称之为 RoseTTAFold,是免费提供的。来自世界各地的科学家现在正在使用它来构建蛋白质模型,以加速他们自己的研究。自 7 月以来,该程序已被 140 多个独立研究团队从 GitHub 下载。
该工具是一个“三轨”神经网络,可同时计算一维蛋白质中的氨基酸序列、二维蛋白质的氨基酸相互作用的方式以及蛋白质可能的三维结构,一维、二维和三维信息来回流动,使神经网络能推理出蛋白质的化学部分与其折叠结构间的关系。
该工具拥有媲美甚至优于AlphaFold2预测蛋白质结构的超高准确度,且速度更快、所需计算机处理能力更低,仅用一台游戏计算机就能在十分钟内计算出蛋白质结构。获取更多前沿科技 研究进展 访问:https://byteclicks.com
此外,该工具的代码和服务器完全免费,可供科学家下载并构建蛋白质模型,以加速相关领域的研究,解决重要的生物学问题。相关研究成果发表于《科学》期刊。
这项工作得到了微软、开放慈善项目、施密特期货、华盛顿研究基金会、国家科学基金会、威康信托基金和国家卫生研究院的部分支持。
