创新计算工具利用AI技术开创癌症免疫疗法新前景

近年来，随着科技的发展，人工智能在医疗领域的应用日益广泛。尤其是在癌症免疫疗法的研究中，人工智能发挥着越来越重要的作用。近日一项研究，介绍了一种创新计算工具。该工具旨在帮助将癌症免疫疗法带给更广泛的患者。这一研究成果不仅为癌症免疫疗法提供了新的治疗靶标，而且挑战并扩展了我们对癌症生物学的理解。

2024年1月17日，《科学转化医学》发表了一项研究，介绍了一种名为“SNAF”的创新计算工具。该工具由辛辛那提儿童医院和弗吉尼亚大学的多学科研究团队开发，旨在帮助将癌症免疫疗法的新兴前景带给更广泛的患者。

SNAF，即剪接新抗原查找器，通过识别高达90%的癌症患者中存在的共享剪接新抗原，不仅提出了新的治疗靶标，而且挑战并扩展了我们对癌症生物学的理解。该工具利用人工智能方法，可以预测T细胞可以识别的免疫原性肽，以及B细胞可以靶向的具有改变的细胞外成分的新型蛋白质。这种双重方法对于开发涉及适应性免疫系统双臂的综合免疫疗法至关重要。

在对替代mRNA途径产生的所有可能的新抗原进行分类时，研究小组发现剪接新抗原的量与黑色素瘤患者的生存率和免疫治疗反应相关。其中，SLC45A2因其高肿瘤特异性和免疫原性，已成为一个特别有前途的靶点。

此外，研究团队还通过SNAF-B发现了新型肿瘤特异性细胞外新表位，称为ExNeoEpitopes。这些ExNeoEpitopes对单克隆抗体和CAR-T细胞疗法的开发显示出巨大的前景。

研究人员表示，SNAF工作流程的灵活性意味着它可以不断调整，随着我们进一步了解和对抗癌症，它将发挥更大的作用。目前，研究团队正在将这些工具应用于最难治疗的癌症，以寻找治疗开发的最佳靶点并了解其单细胞起源。

该研究得到了多项资助，包括辛辛那提儿童医院研究基金会、辛辛那提大学癌症中心、黑色素瘤研究基金会、美国癌症协会和美国国立卫生研究院。