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新研究揭示了奥密克戎“Omicron”变体的起源

一年前在南非首次发现,后来被称为奥密克戎“Omicron”的新冠病毒变种以惊人的速度在全球传播。目前尚不清楚这种病毒究竟是如何、何时何地起源的。现在,柏林 Charité – Universitätsmedizin Berlin 和非洲机构网络的研究人员在《科学》杂志上发表的一项研究表明,在首次发现病例之前很久,Omicron 的前身就已经存在于非洲大陆,这表明 Omicron 在几个月内逐渐出现在不同的国家横跨非洲。

自大流行开始以来,冠状病毒一直在不断变化。迄今为止,新冠病毒进化的最大飞跃是研究人员在一年前观察到的,当时发现了一个变体,该变体与原始病毒的基因组有 50 多个突变不同。该变体于 2021 年 11 月中旬首次在南非的一名患者身上被发现,后来被命名为 Omicron BA.1 的变体在短短几周内传播到全球 87 个国家。到 12 月底,它已经取代了之前在全球范围内占主导地位的 Delta 变体。

从那时起,关于这种高度传染性变体的起源的猜测围绕着两个主要理论:要么冠状病毒从人类跳到动物,进化成 Omicron 再次感染人类,要么是病毒在免疫系统受损的人身上存活了更长时间,这就是突变发生的原因。现在,对首次检测到 Omicron 之前在非洲收集的 COVID-19 样本进行的新分析对这两种假设提出了质疑。

这项分析是由一个国际研究团队进行的,该团队由Jan Felix Drexler教授领导,他是Charité病毒学研究所和德国感染研究中心(DZIF)的科学家。欧洲-非洲网络的其他主要合作伙伴包括南非斯特伦博斯大学和贝宁病毒性出血热实验室。科学家们首先开发了一种特殊的PCR检测方法,专门检测Omicron变异株BA.1。然后,他们检测了21年年中至2022年初在22个非洲国家采集的13000多份新冠肺炎患者的呼吸道样本。在这个过程中,该研究小组在2021 8月和9月感染新冠肺炎的6个不同国家的25名患者中发现了Omicron特异性突变的病毒,这比南非首次检测到变异病毒的提前两个月。

为了进一步了解奥密克戎的起源,研究人员还解码或“测序”了约670个样本的病毒基因组。这种测序使检测新的突变和鉴定新的病毒谱系成为可能。该团队发现了几种与奥密克戎有不同程度相似性的病毒,但它们并不完全相同。数据显示,奥密克戎有不同的祖先,它们相互作用,并在非洲传播,有时同时传播数月。这表明BA.1奥密克戎变异株是逐渐进化的,在此期间,该病毒越来越适应现有的人类免疫力。此外,PCR数据使研究人员得出结论,尽管奥密克克戎并非仅起源于南非,但它首先主导了南非的感染率,然后在几周内从南向北传播到整个非洲大陆。获 取 更多硬科技 前沿访问:https://byteclicks.com

事实上,奥密克戎让我们措手不及,这是由于非洲大部分地区存在诊断盲点,据推测,那里甚至只有一小部分新冠感染病例被记录在案。因此,奥密克戎的逐渐演变被忽视了。因此,我们现在必须在非洲大陆大力加强诊断监测系统。 同时也促进全球数据共享。只有良好的数据才能防止决策者在错误的时间实施可能有效的遏制措施,否则这最终可能会造成更多的经济和社会危害。

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