新的更详细的抗生素耐药性世界地图
在新冠大流行期间，全世界都意识到使用污水分析来监测一个地区疾病发展的价值。然而，在 DTU 国家食品研究所，一组研究人员自 2016 年以来一直在使用来自世界各地的污水监测作为监测传染病和抗生素耐药性的有效且廉价的工具。
通过分析 DTU 在 2016 年至 2019 年间从 101 个国家的 243 个城市接收的污水样本，研究人员现已绘制出世界上耐药基因发生率最高的地区、这些基因的位置以及它们在哪些类型的细菌中被发现.
刚刚发表在 Nature Communications 上的宏基因组研究的新结果令研究人员感到惊讶。事实上，该研究表明，这些基因出现在许多不同的遗传背景和细菌类型中，表明传播比研究人员预期的要大。
在这项研究中，研究人员分析了来自 101 个国家 243 个城市的 757 个污水样本。这些样本是在 2016 年至 2019 年间收集并发送到 DTU 位于 Lyngby 的校园的。废水的基因组分析是快速且相当便宜的。
有关该研究结果的更多信息：来自 101 个国家/地区的污水的基因组分析揭示了全球抗菌素耐药性格局。
DTU 国家食品研究所的基因组流行病学研究小组开发并维护着世界上最全面的耐药性数据库之一。它目前包括 3,134 个已知的抗性基因。在新研究中，研究人员使用该数据库绘制了污水样本中的抗性基因图谱。
样品中含有大量来自不同来源的微生物，包括人类粪便。冷冻的污水样本已被送到DTU，实验室技术人员从解冻的样本中提取所有细菌。
然后细菌被分解，它们的集体 DNA 被分解成更小的片段，最先进的 DNA 测序设备可以一次读取所有这些片段。然后超级计算机可以将数十亿记录的 DNA 序列与已知基因进行比较，并构建样本中包含的更大的原始基因组片段。
与来自传统分析方法的数据不同，来自宏基因组研究的原始数据可以重复使用以阐明其他问题。例如，污水项目的研究人员使用他们的数据集分析了污水中其他病原微生物的发生情况。获 取 更多硬科技 前沿访问：https://byteclicks.com
污水监测的整个数据集已免费提供给全世界的研究人员。例如，它已被用于在全球范围内检测许多新病毒并绘制不同人群的种族构成图。
随着新的抗性基因的发现——即使是在遥远的未来——研究人员将能够重复使用原始数据来快速确定它们首先出现的位置以及传播方式。
