人类免疫学数据工具的新型开放访问门户

艾伦免疫学研究所的研究人员自 2018 年底艾伦研究所分部成立以来，由免疫学家、分子和计算生物学家、工程师和其他工作人员组成的 60 人团队一直在建立一种新的研究方法来处理大量数据通过实验和分析的方式：长期研究免疫系统在人类健康生活过程中或免疫相关疾病期间如何变化。 

现在，该部门为所有人建立了一个新的在线门户网站，以探索他们的工作细节，并最终探索与健康和疾病相关的人类数据。 

今天推出的人类免疫系统资源管理器是艾伦免疫学研究所面向更广泛社区的数据共享门户。该网站使用去识别和匿名数据构建，允许科学家深入研究免疫学团队用于分析和管理人类免疫学研究的方法和资源。随着该团队对免疫健康和疾病的长期研究完成，这些数据也将存储在公共门户上。研究人员希望通过向公众公开他们的数据，科学界的其他人将梳理这些数据，以对人类免疫学提出自己的见解，最终可能为免疫相关疾病带来更好、更精确的疗法。 人体免疫系统资源管理器为正在进行的人类健康和疾病研究提供了内部视角。

随着免疫学团队建立了一个专门的流程，也称为研究程序，以开展对人类免疫健康和疾病的多年研究，包括对 COVID-19、癌症和自身免疫性疾病的免疫系统研究，他们意识到他们需要开发新的方法来研究免疫系统并分析结果数据。由于他们继续跟踪健康和患者志愿者两年或更长时间，开放访问平台上的第一个公开版本包含与这些新开发的方法相关的数据和工具。长期研究本身的数据将在未来几年在公共门户网站上发布。

第一个公开版本包括：

• 描述该团队研究流程的协议，该流程除了临床数据外，还随时间从同一个人身上捕获并整合了五种不同类型的人体免疫系统分子数据
• 一种名为 TEA-seq 的新方法和随附的数据可视化应用程序，可同时从单个人体免疫细胞中捕获三种类型的数据：细胞表面存在的蛋白质；在每个细胞中开启或表达的一组基因；以及细胞的“表观遗传”景观，它提供了有关其基因如何被调节的线索
• 数据和伴随的交互式可视化团队发现延迟处理人类血液样本会改变免疫细胞的某些分子特性（这一发现导致团队及其外部合作者在从研究志愿者身上采集血液样本后标准化快速处理血液样本)
• 一种名为 PALMO（用于分析纵向多组学数据的平台）的新方法和随附的数据可视化应用程序用于分析纵向多组学数据——即捕获多种信息的数据，例如全基因组基因活性或全细胞蛋白质在几个时间点从患者收集的样本中，来自数千或更多单细胞的水平。 
• 一种称为 BarWare 的计算方法包，它跟踪在同一实验中混合在一起的单个细胞的原始来源，并将它们分解以进行分析。

云端协作

面向公众的门户是实验和计算流程的最后一步，其中包括一个定制的协作和数据分析空间，供艾伦免疫学研究所的研究人员及其外部临床合作者在云中共同开展研究项目。该环境也是人类免疫系统资源管理器的一部分，由艾伦免疫学研究所的工程师与 Google Cloud 合作创建。 

这个安全平台可确保患者隐私和数据完整性，并允许研究人员无缝合作准备数据以在科学期刊并在公共门户网站上发布。所有患者数据在上传到封闭、安全的平台之前都经过脱敏处理。然后，某些数据和其他资源将向公众发布，网站的开放访问部分。 获 取 更多前沿科技 研究 进展访问：https://byteclicks.com