研究癌症基因的共享网络

威尔莫特癌症研究所的研究人员离了解导致细胞恶性的复杂基因相互作用又近了一步。近日发表的一项新的Cell Reports研究中，该小组使用网络建模来研究一组对恶性肿瘤至关重要的相互作用。

可以被药物靶向的离散基因突变仅在一小部分癌症类型中被发现。但是这些突变依赖于非突变基因的下游网络才能导致癌症。这些下游基因——以及它们错综复杂的相互作用——可能在许多癌症中很常见，并可能为癌症治疗带来巨大的飞跃。 

该研究的另一位主要作者麦考尔开发了一种新的网络建模方法，称为 TopNet，该小组将其与细胞和小鼠的基因实验配对，以确定功能相关的基因网络。

TopNet 考虑的可能基因网络模型的数量比宇宙中估计的原子数量大很多倍。在剔除与观察到的数据不相符的模型并进一步关注至少 80% 的模型中出现的基因相互作用后，该团队只剩下一组易于管理的 24 个高置信度基因相互作用。随后的实验表明，这些相互作用通常在恶性肿瘤中发挥重要作用。

该小组已经测试了 TopNet 揭示的遗传相互作用的样本，并通过细胞和小鼠的实验证实了相互作用在功能上是相关的。接下来，该小组打算测试 TopNet 的局限性，目的是使用这种方法来寻找广泛有效的潜在癌症疗法。

这项工作是2015 年授予 Land 的 630万美元美国国家癌症研究所杰出研究员奖和国家人类基因组研究所授予 McCall 的 K99/R00 资助的一部分。获取更多前沿科技 研究进展 访问：https://byteclicks.com