美科学家团队开发Stream-AI-MD平台推进COVID-19前沿创新研究

阿贡、工业界和学术界合作，为 COVID-19前线带来创新的人工智能和仿真工具。美国能源部 (DOE) 的阿贡国家实验室正在努力将人工智能 (AI) 和尖端模拟工作流程结合起来，以更好地了解生物学观察和加速药物发现。

他们借助AI技术以了解 SARS-CoV-2 病毒基因组中的两种蛋白质 nsp10 和 nsp16 如何相互作用以帮助病毒复制并逃避宿主的免疫系统。

这种在新兴硬件平台上支持流式AI和 MD技术的迭代工作流程将为推进我们对蛋白质功能的了解铺平道路。

该团队通过耦合两个不同的硬件平台实现了这一里程碑：Cerebras CS-1，一种处理器封装的硅晶片深度学习加速器；ThetaGPU 是 Theta 超级计算机的人工智能和仿真扩展。

为了实现这一功能，该团队开发了 Stream-AI-MD，这是一种称为深度学习的人工智能方法的新应用，以流式方式驱动自适应分子动力学 (MD) 模拟。模拟数据从 ThetaGPU 传输到 Cerebras CS-1 平台，以同时分析两种蛋白质如何相互作用。

该 研究发表 在 2021 年 7 月 5 日至 9 日在瑞士日内瓦举行的高级科学计算平台会议 (PASC ’21) 的会议中【Stream-AI-MD: Streaming AI-driven Adaptive Molecular Simulations for Heterogeneous Computing Platforms】。

这项研究是 Argonne 和 Cerebras Systems Inc. 之间的合作，得到了 Exascale 计算项目的支持，这是美国能源部科学办公室和国家核安全管理局的合作项目；由美国能源部科学办公室通过国家虚拟生物技术实验室组成，由美国能源部国家实验室组成的联盟专注于应对 COVID-19，资金由《冠状病毒援助、救济和经济安全（CARES）法案》提供。 获取更多前沿科技 研究进展 访问：https://byteclicks.com