新型AI工具TopoFormer：加速药物开发进程

一项由密歇根州立大学（MSU）团队开发的新型 AI 程序将帮助研究人员提升药物发现的效率。该程序名为 TopoFormer。TopoFormer 能将分子三维信息转化为 AI 药物交互模型可用的数据，从而提高这些模型预测药物效果的能力。

TopoFormer 的优势

药物开发是一个耗时且昂贵的过程，在美国，开发一种新药大约需要十年时间，花费约 20 亿美元。TopoFormer 有望缩短开发时间，降低成本，从而减少消费者的药物价格，尤其对罕见疾病的治疗有重要意义。

目前，研究人员使用计算机模型辅助药物发现，但这些模型有很多限制，主要在于无法全面考虑分子的三维形状。TopoFormer 通过将蛋白质和药物的三维交互信息转化为一维数据，解决了这一问题。

TopoFormer 的工作原理

TopoFormer 是一种转换模型，类似于 OpenAI 的 ChatGPT。它通过读取蛋白质和药物的三维结构信息，并将其转化为一维序列，使当前的 AI 模型能够理解和使用这些信息。TopoFormer 使用数万条蛋白质-药物交互数据进行训练，每个交互被记录为一个“词”，这些词串联起来形成描述药物-蛋白质复合物形状的“句子”。

这些句子可以被其他预测新药交互的模型读取，为其提供更多的背景信息。如果将新药比作一本书，TopoFormer 能够将一个粗略的故事梗概转化为一个完整的情节。获取更多有价值信息 访问：https://byteclicks.com

TopoFormer 的推出，标志着药物发现领域的一次重要进步，利用 AI 技术，研究人员能够更高效、更经济地开发新药，有望为患者带来更多福音。

该团队研究成果发表在《自然机器智能》上。