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ASAP推出帕金森病研究数据共享平台

Aligning Science Across Parkinson’s (ASAP) 推出了一个数据共享平台,旨在为全球研究人员提供高价值的帕金森病研究数据。这个新平台名为ASAP CRN Cloud,首批数据来自156名捐赠者的独特的人类尸检脑样本,最终数据集将包含629名捐赠者的数据,并会定期发布新数据。

ASAP CRN Cloud 汇集了ASAP网络中的资源,为研究人员提供一个共享和访问数据的单一平台,使他们能够与其他顶尖专家合作,深入研究神经退行性疾病。平台的初始数据来源于ASAP的协作研究网络,这个网络由多个国际、跨学科和多机构的科学家团队组成,专注于解决帕金森病的基础科学问题。

ASAP副主任Sonya Dumanis博士表示:“人类尸检脑样本和数据是研究神经退行性疾病的重要资源,但十分有限。通过CRN Cloud,ASAP和我们的合作伙伴在一个地方实现了数据的民主化和联邦化,建立了负责任的开放访问数据和资源,增强了研究社区的每一个贡献的影响力,并加快了研究成果的产生。”

该平台的首批数据集包括单细胞转录组数据,这种数据允许独立分析每个细胞的基因表达情况,从而更好地了解神经退行性疾病的病理变化。这种方法已经在包括癌症在内的许多疾病研究中提供了关键的见解。

ASAP 与实施合作伙伴迈克尔·福克斯帕金森病研究基金会以及 DataTecnica、DNAstack 和 Verily 的技术合作伙伴共同开发了该工具。  

  • DataTecnica的技术有助于从预处理到注释的分析,确保数据集的协调和高质量。 
  • DNAstack提供了一个数据平台,允许将数据安全地存储在云环境中,同时仍然可以被更广泛的研究网络访问——这种技术称为数据联合。 
  • Verily Viewpoint Workbench创造了一个协作环境,世界各地的科学家都可以访问、分析和共享数据。将数据、治理和分析资源整合到一个全球共享平台中,使数据民主化,从而支持和赋能一个不受本地资源限制的充满活力的全球研究社区。

有兴趣访问数据的研究人员可以访问https://cloud.parkinsonsroadmap.org 并在平台内提交数据使用申请。申请需要提供研究人员的角色、机构和数据的预期用途,并同意数据使用协议的条款。一旦获得数据访问权限,研究人员将可以访问所有数据集。获取更多有价值信息 访问:https://byteclicks.com

ASAP继续通过从单个脑细胞的转录组数据到庞大的联邦数据网络,汇聚信息和合作伙伴,以减少数据访问的障碍,推进帕金森病的研究。

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