HudsonAlpha推出改善植物育种的工具

在近八年的花生育种和遗传学领域工作中，哈德森阿尔法生物技术研究所的研究员Josh Clevenger 博士对改良作物以实现更稳健和可持续的农业充满热情。这促使与 HudsonAlpha 计算生物学家 Walid Korani 博士合作，并创建了一种名为Khufu的计算工具，以快速准确地识别和分析这种复杂基因组中的变异。

为了将性状映射到基因，所研究植物的 DNA 序列必须与参考基因组对齐。当关注复杂的植物基因组时，软件很难将短 DNA 读数映射到参考基因组并准确识别与观察到的性状相关的单核苷酸多态性 (SNP) 等分子标记。

经过多年努力识别花生中的 SNP，Clevenger 与 Korani 一起开发了一种解决方案，即新的计算工具Khufu (www.hudsonalpha.org/khufudata/plant-improvement)。

Khufu 使用非常低的覆盖率序列数据提供了极其准确的 SNP 识别。由于每个个体需要的序列较少，因此即使在小型育种计划中，全基因组测序的成本也是可行的。全基因组标记的可用性大大提高了性状图谱和整合能力和精度，并将这些工具提供给更广泛的育种者和遗传学家。  

Khufu 提供基因型的全面分析，为感兴趣的性状提供标记目标，并节省宝贵的时间。Khufu 是一个高度准确的信息学平台，其性能优于已发表的方法。

该工具最初是为 Clevenger 和 Korani 对花生种群的研究而开发的，但通过重新分析之前研究中的其他大型数据集，该工具在各种物种和种群中的工作情况变得清晰起来。无论种群结构或基因组复杂性如何，Khufu都可以有效地对少量或大量植物进行基因分型。获取更多前沿科技 研究进展 访问：https://byteclicks.com

关于 HudsonAlpha： HudsonAlpha 生物技术研究所是一家非营利机构，致力于开发和应用科学进步以促进健康、农业、学习和商业化。HudsonAlpha 生物技术园区占地 152 英亩，坐落在美国第二大研究园区卡明斯研究园区内。

HudsonAlpha 是遗传学和基因组学研究以及生物技术教育的国内和国际领导者，培育了超过 45 家多样化的生物技术公司。要了解有关 HudsonAlpha 的更多信息，请访问 hudsonalpha.org