科学家开发的Bioteque生物知识图谱工具开放访问

近几十年来，生物和生物医学研究领域（如基因组学、蛋白质组学和转录组学）不同学科的快速发展导致可用生物数据量呈指数级增长。例如，在欧洲生物信息学研究所 (EMBL-EBI)，他们在短短 6 年内就从管理 40 PB 的容量发展到使用 250 PB 的容量。

由ICREA 研究员兼IRB 巴塞罗那结构生物信息学和网络生物学实验室负责人Patrick Aloy 博士领导的科学家们开发了一种计算工具Bioteque协调、整合和简化这些数据。结果是一个知识图谱，提供了有关不同生物实体如何相互关联的信息，包括超过 3000 万个功能交互。

Bioteque 通过整合不同级别的生物复杂性来工作，因此可以报告例如两个相关的基因，它们是否发生物理相互作用，它们是否在相同类型的细胞中活跃，以及它们是否与相同的疾病有关. 它还可以预测一种细胞对特定药物的敏感性或抗性。

12 个生物实体的近 1,000 个描述符

Bioteque 中保存的信息被结构化为 12 种生物实体，例如基因、疾病、组织、细胞等。对于这些实体中的每一个，该工具都会考虑一系列描述符或特征，例如突变模式基因、所得蛋白质的物理相互作用的概况、所述基因在不同细胞类型中的表达或其与不同疾病的关系。在 12 个生物实体中，该系统涵盖了大约 1000 种描述符。获 取 更多前沿科技 研究 进展访问：https://byteclicks.com

Bioteque 将随着新数据库的公开而定期扩展。该工具以及数据库和算法都是开放访问的，可在此处获取：https://bioteque.irbbarcelona.org。